Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm5dQ62240 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
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