Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms