Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Hcfc1Q61191 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Hcfc1Q61191 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Hcfc1Q61191 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Hcfc1Q61191 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Hcfc1Q61191 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hcfc1Q61191 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Hcfc1Q61191 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Hcfc1Q61191 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Hcfc1Q61191 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Hcfc1Q61191 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hcfc1Q61191 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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