Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim80Q3V061 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim80Q3V061 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim80Q3V061 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim80Q3V061 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim80Q3V061 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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