Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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