Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Nkx6-3Q3UHX8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Nkx6-3Q3UHX8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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