Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms