Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Specc1lQ2KN98 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms