Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spatc1Q148B6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms