Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms