Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cntnap5bQ0V8T8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cntnap5bQ0V8T8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cntnap5bQ0V8T8 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cntnap5bQ0V8T8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cntnap5bQ0V8T8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms