Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms