Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms