Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VcpQ01853 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VcpQ01853 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VcpQ01853 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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