Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms