Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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