Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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Vbp1P61759 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vbp1P61759 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Vbp1P61759 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vbp1P61759 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vbp1P61759 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vbp1P61759 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vbp1P61759 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vbp1P61759 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vbp1P61759 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vbp1P61759 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Vbp1P61759 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Vbp1P61759 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Vbp1P61759 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Vbp1P61759 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Vbp1P61759 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Vbp1P61759 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vbp1P61759 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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