Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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