Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23aP54726 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23aP54726 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23aP54726 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23aP54726 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad23aP54726 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad23aP54726 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23aP54726 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23aP54726 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23aP54726 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23aP54726 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23aP54726 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23aP54726 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23aP54726 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23aP54726 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23aP54726 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23aP54726 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23aP54726 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23aP54726 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23aP54726 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23aP54726 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23aP54726 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23aP54726 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23aP54726 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms