Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpaP53566 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpaP53566 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpaP53566 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpaP53566 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpaP53566 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpaP53566 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpaP53566 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpaP53566 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpaP53566 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpaP53566 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpaP53566 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpaP53566 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpaP53566 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpaP53566 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpaP53566 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpaP53566 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpaP53566 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpaP53566 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpaP53566 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms