Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcnfP51944 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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