Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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