Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxc10P31257 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc10P31257 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc10P31257 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc10P31257 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc10P31257 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc10P31257 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc10P31257 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc10P31257 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc10P31257 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc10P31257 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc10P31257 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc10P31257 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc10P31257 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms