Protein–RNA interactions for Protein: P31001

Des, Desmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DesP31001 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DesP31001 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DesP31001 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DesP31001 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DesP31001 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DesP31001 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DesP31001 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DesP31001 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DesP31001 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DesP31001 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DesP31001 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DesP31001 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DesP31001 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DesP31001 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DesP31001 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DesP31001 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DesP31001 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DesP31001 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DesP31001 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DesP31001 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DesP31001 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DesP31001 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DesP31001 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DesP31001 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DesP31001 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DesP31001 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DesP31001 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DesP31001 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DesP31001 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DesP31001 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DesP31001 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms