Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcdP28867 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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