Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms