Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms