Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChgaP26339 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChgaP26339 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChgaP26339 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChgaP26339 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms