Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BdnfP21237 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BdnfP21237 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BdnfP21237 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BdnfP21237 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BdnfP21237 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BdnfP21237 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BdnfP21237 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BdnfP21237 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BdnfP21237 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BdnfP21237 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BdnfP21237 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BdnfP21237 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BdnfP21237 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BdnfP21237 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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BdnfP21237 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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BdnfP21237 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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BdnfP21237 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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BdnfP21237 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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BdnfP21237 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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BdnfP21237 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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BdnfP21237 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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BdnfP21237 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BdnfP21237 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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