Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms