Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18530 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18530 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18530 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18530 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18530 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18530 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18530 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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