Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms