Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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DmdP11531 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DmdP11531 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DmdP11531 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DmdP11531 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DmdP11531 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DmdP11531 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DmdP11531 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DmdP11531 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DmdP11531 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DmdP11531 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DmdP11531 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DmdP11531 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DmdP11531 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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DmdP11531 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DmdP11531 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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DmdP11531 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DmdP11531 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DmdP11531 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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DmdP11531 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DmdP11531 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DmdP11531 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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DmdP11531 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DmdP11531 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DmdP11531 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DmdP11531 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DmdP11531 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DmdP11531 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DmdP11531 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DmdP11531 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DmdP11531 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DmdP11531 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DmdP11531 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DmdP11531 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DmdP11531 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
DmdP11531 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DmdP11531 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DmdP11531 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DmdP11531 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
DmdP11531 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DmdP11531 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DmdP11531 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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