Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClppO88696 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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ClppO88696 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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ClppO88696 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClppO88696 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ClppO88696 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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ClppO88696 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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ClppO88696 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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