Protein–RNA interactions for Protein: O55022

Pgrmc1, Membrane-associated progesterone receptor component 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgrmc1O55022 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pgrmc1O55022 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms