Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms