Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stag2O35638 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms