Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx1aO35526 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms