Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Prrt1O35449 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Prrt1O35449 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Prrt1O35449 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Prrt1O35449 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Prrt1O35449 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Prrt1O35449 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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