Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casq1O09165 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casq1O09165 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casq1O09165 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casq1O09165 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Casq1O09165 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Casq1O09165 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Casq1O09165 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Casq1O09165 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casq1O09165 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casq1O09165 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms