Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 CT025579.2-201ENSMUST00000225280 816 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 C230053D17Rik-201ENSMUST00000214451 2246 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Eno4-201ENSMUST00000054280 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Lgals9-202ENSMUST00000108268 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 A130023I24Rik-201ENSMUST00000152709 1897 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms