Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms