Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms