Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Usp9yF8VPU6 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Usp9yF8VPU6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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