Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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