Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Herc6F2Z461 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Herc6F2Z461 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Herc6F2Z461 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Herc6F2Z461 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Herc6F2Z461 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Herc6F2Z461 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Herc6F2Z461 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Herc6F2Z461 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Herc6F2Z461 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Herc6F2Z461 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Herc6F2Z461 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms