Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms