Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp839E9PUU5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp839E9PUU5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms