Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC035044E0CXF8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC035044E0CXF8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms