Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms